Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SGCBQ16585 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SGCBQ16585 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SGCBQ16585 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SGCBQ16585 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SGCBQ16585 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SGCBQ16585 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SGCBQ16585 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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