Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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