Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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