Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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