Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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TTF1Q15361 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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