Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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TRAM2Q15035 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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TRAM2Q15035 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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TRAM2Q15035 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAM2Q15035 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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