Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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LAPTM4AQ15012 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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LAPTM4AQ15012 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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LAPTM4AQ15012 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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LAPTM4AQ15012 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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