Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SHPRHQ149N8 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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SHPRHQ149N8 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SHPRHQ149N8 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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SHPRHQ149N8 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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SHPRHQ149N8 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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