Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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RAB39AQ14964 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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RAB39AQ14964 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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RAB39AQ14964 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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