| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.216-201 | ENST00000364205 | 93 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-188P-201 | ENST00000364207 | 107 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.367-201 | ENST00000365544 | 101 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AIF1-202 | ENST00000376049 | 524 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA32.2-201 | ENST00000384049 | 122 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR454-201 | ENST00000390180 | 115 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRAJ21-201 | ENST00000390516 | 55 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA75.4-201 | ENST00000391278 | 119 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL136116.1-201 | ENST00000403591 | 381 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445189.1-201 | ENST00000405722 | 338 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NDUFB4P5-201 | ENST00000415445 | 361 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004870.4-201 | ENST00000424359 | 360 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL35AP12-201 | ENST00000425362 | 338 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL353612.1-201 | ENST00000428769 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL356867.1-201 | ENST00000429623 | 299 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | LINC01757-201 | ENST00000435552 | 480 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL7P12-201 | ENST00000446719 | 750 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL356010.1-201 | ENST00000456364 | 102 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.632-201 | ENST00000459189 | 102 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SL542P-201 | ENST00000467147 | 294 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL7P5-201 | ENST00000471472 | 736 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC079943.1-201 | ENST00000491909 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008539.1-201 | ENST00000507653 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC104619.4-201 | ENST00000510773 | 249 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC113385.1-201 | ENST00000511468 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC126768.3-201 | ENST00000514519 | 560 nt | TSL 4 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-95P-201 | ENST00000516357 | 160 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-128P-201 | ENST00000516704 | 160 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRMT10BP1-201 | ENST00000519377 | 943 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC026333.2-201 | ENST00000542164 | 106 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090985.1-201 | ENST00000554440 | 480 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CCDC178-211 | ENST00000581852 | 876 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010591.1-201 | ENST00000603941 | 649 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL354950.2-201 | ENST00000617939 | 290 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC022149.2-201 | ENST00000621061 | 203 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007998.5-201 | ENST00000622938 | 237 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL133216.2-202 | ENST00000634512 | 349 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KIAA0586-215 | ENST00000619722 | 5597 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SDAD1P2-201 | ENST00000441308 | 2028 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FOXP2-224 | ENST00000635534 | 4290 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KCNJ16-203 | ENST00000392671 | 3981 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KLRA1P-202 | ENST00000510134 | 1410 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006020.1-201 | ENST00000420179 | 1854 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MAPK10-322 | ENST00000641485 | 4530 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PTPN22-211 | ENST00000538253 | 3575 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UEVLD-208 | ENST00000535484 | 1963 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ABCA5-208 | ENST00000588877 | 6525 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CCDC168-201 | ENST00000322527 | 21466 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA5A-201 | ENST00000384111 | 134 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA36C-201 | ENST00000384289 | 132 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA1.3-201 | ENST00000384676 | 136 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BTF3L4P3-201 | ENST00000418879 | 476 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL27AP8-201 | ENST00000424277 | 446 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C21orf91-OT1-202 | ENST00000430815 | 717 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL365400.1-201 | ENST00000431854 | 640 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GPM6BP2-201 | ENST00000432046 | 144 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTATP6P16-201 | ENST00000434543 | 526 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GPM6BP1-201 | ENST00000446387 | 144 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL133351.1-201 | ENST00000456189 | 417 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP310-201 | ENST00000459084 | 116 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL37P6-201 | ENST00000460682 | 294 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091179.1-201 | ENST00000461606 | 579 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND4P17-201 | ENST00000470444 | 350 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL049874.1-201 | ENST00000489560 | 388 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NREP-AS1-201 | ENST00000503242 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC100773.1-201 | ENST00000505409 | 520 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC131956.2-201 | ENST00000510922 | 512 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC105417.1-201 | ENST00000514691 | 285 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU2-27P-201 | ENST00000516185 | 142 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-45P-201 | ENST00000517191 | 141 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4425-201 | ENST00000580572 | 84 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01894-201 | ENST00000580984 | 487 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006130.2-201 | ENST00000586202 | 326 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC067852.3-201 | ENST00000589177 | 561 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC104534.1-201 | ENST00000594558 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL121655.1-201 | ENST00000605811 | 308 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC116312.1-201 | ENST00000606841 | 314 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL512625.3-207 | ENST00000609749 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP003355.3-201 | ENST00000623465 | 114 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL137003.2-201 | ENST00000606924 | 2538 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ARHGAP12-201 | ENST00000311380 | 4625 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MCF2-202 | ENST00000370573 | 2583 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND4P35-201 | ENST00000604257 | 1375 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MBNL1-220 | ENST00000493459 | 4205 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GMFB-208 | ENST00000554908 | 6721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PWAR6-201 | ENST00000552334 | 4618 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA62.1-201 | ENST00000364287 | 154 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-996P-201 | ENST00000365438 | 107 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-20P-201 | ENST00000365601 | 151 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR23B-201 | ENST00000384832 | 97 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LGALS16-201 | ENST00000392051 | 624 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP32-201 | ENST00000410167 | 303 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP202-201 | ENST00000410439 | 330 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC239803.1-203 | ENST00000411978 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RBM6-203 | ENST00000421682 | 684 nt | TSL 2 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL645937.1-202 | ENST00000421799 | 937 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL7P46-201 | ENST00000425129 | 740 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SRIP2-201 | ENST00000428470 | 166 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATP5JP1-201 | ENST00000431631 | 322 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |