Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTTNQ14247 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms