Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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UBE4AQ14139 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
UBE4AQ14139 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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