Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CAPSQ13938 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CAPSQ13938 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms