Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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