Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1SQ13698 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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