Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms