Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL3Q13618 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms