Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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