Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXE3Q13461 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXE3Q13461 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXE3Q13461 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXE3Q13461 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXE3Q13461 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXE3Q13461 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXE3Q13461 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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