Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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