Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
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ITGB3BPQ13352 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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ITGB3BPQ13352 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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ITGB3BPQ13352 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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ITGB3BPQ13352 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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