Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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