Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RIGQ13278 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RIGQ13278 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms