Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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