Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms