Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB40BQ12829 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms