Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms