Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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PTPRBP23467 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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PTPRBP23467 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
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PTPRBP23467 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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