Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHOC2Q9UQ13 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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