Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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