Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms