Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms