Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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