Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms