Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms