Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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