Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms