Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms