Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCLAFQ15004 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms