Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms