Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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PDE6HQ13956 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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PDE6HQ13956 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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