Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCINQ13939 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCINQ13939 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCINQ13939 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCINQ13939 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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