Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms