Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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DDX39BQ13838 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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DDX39BQ13838 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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