Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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