Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNTA1Q13424 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms