Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms