Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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PTGDRQ13258 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTGDRQ13258 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTGDRQ13258 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTGDRQ13258 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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