Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms