Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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